此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见microbiomeDASim.
Bioconductor版本:3.11
为纵向分析而设计的模拟差异微生物组数据的工具包。可以为平均趋势指定几种函数形式。观测结果来自多元正态模型。该软件包的目标是能够模拟数据,以便准确地比较不同的纵向差分丰度方法。
作者:贾斯汀·威廉姆斯,赫克托·科拉达·布拉沃,詹妮弗·汤姆,约瑟夫·纳撒尼尔·保尔森
维护者:Justin Williams < williamazo at ucla.edu>
引文(从R内,输入引用(“microbiomeDASim”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“microbiomeDASim”)
R脚本 | microbiomeDASim | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 微生物组,软件,可视化 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | bio3.10 (R-3.6)(1年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.6.0) |
进口 | 图形,ggplot2,质量,tmvtnorm,矩阵,mvtnorm,pbapply统计数据,phyloseq,metagenomeSeq,Biobase |
链接 | |
建议 | testthat(> =魅惑,knitr,devtools |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/williazo/microbiomeDASim |
BugReports | https://github.com/williazo/microbiomeDASim/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | microbiomeDASim_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | microbiomeDASim_1.2.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | microbiomeDASim_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiomeDASim |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/microbiomeDASim |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/microbiomeDASim/ |
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