microbiomeDASim

DOI:10.18129 / B9.bioc.microbiomeDASim

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见microbiomeDASim

微生物组差异丰度模拟

Bioconductor版本:3.11

为纵向分析而设计的模拟差异微生物组数据的工具包。可以为平均趋势指定几种函数形式。观测结果来自多元正态模型。该软件包的目标是能够模拟数据,以便准确地比较不同的纵向差分丰度方法。

作者:贾斯汀·威廉姆斯,赫克托·科拉达·布拉沃,詹妮弗·汤姆,约瑟夫·纳撒尼尔·保尔森

维护者:Justin Williams < williamazo at ucla.edu>

引文(从R内,输入引用(“microbiomeDASim”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“microbiomeDASim”)

PDF R脚本 microbiomeDASim
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 微生物组软件可视化
版本 1.2.0
在Bioconductor bio3.10 (R-3.6)(1年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.6.0)
进口 图形,ggplot2质量tmvtnorm矩阵mvtnormpbapply统计数据,phyloseqmetagenomeSeqBiobase
链接
建议 testthat(> =魅惑,knitrdevtools
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/williazo/microbiomeDASim
BugReports https://github.com/williazo/microbiomeDASim/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 microbiomeDASim_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 microbiomeDASim_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) microbiomeDASim_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiomeDASim
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/microbiomeDASim
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/microbiomeDASim/
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