mirsm

doi：10.18129/b9.bioc.mirsm

此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅mirsm。

通过整合表达数据和miRNA-target结合信息来推断miRNA海绵模块

生物导体版本：3.11

该软件包旨在通过整合表达数据和miRNA-target结合信息来识别miRNA海绵模块。它提供了一些研究miRNA海绵模块的功能，包括流行的基因模块（候选miRNA海绵模块）的流行方法，以及一个识别miRNA海绵模块的函数，以及进行miRNA海绵模块模块化分析的几种函数。

作者：Junpeng Zhang [AUT，CRE]

维护者：yahoo.com> junpeng zhang

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ mirsm”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ mirsm”）

html	R脚本	miRSM：通过整合表达数据和miRNA靶标结合信息来推断miRNA海绵模块
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	生物医学信息学，，，，聚类，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，基因烯，，，，遗传学，，，，微阵列，，，，软件
版本	1.6.4
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（2年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.5.0）
进口	WGCNA，，，，flashclust，，，，DynamiCtreCut，，，，GFA，，，，Igraph，，，，linkComm，，，，MCL，，，，NMF，，，，biclust，，，，伊比格，，，，法比亚，，，，Bicare，，，，ISA2，，，，S4VD，，，，Bibitr，，，，rqubic，，，，生物酶，，，，PMA，统计dbscan，，，，子空间，，，，mclust，，，，sombrero，，，，ppclust，，，，mirsponger，，，，RCPP，utils，总结性特征，，，，gseabase，，，，org.hs.eg.db，，，，矩阵相交，，，，活力
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试
系统要求
增强
URL	https://github.com/zhangjunpeng411/mirsm
BugReports	https://github.com/zhangjunpeng411/mirsm/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	mirsm_1.6.4.4.tar.gz
Windows二进制	mirsm_1.6.4.4.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	mirsm_1.6.4.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mirsm
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/mirsm
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/mirsm/
软件包下载报告	下载统计