mirnatap

doi:10.18129/b9.bioc.mirnatap

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅mirnatap

mirnatap:microRNA目标 - 汇总预测

生物导体版本:3.11

该软件包促进了需要miRNA预测的工作流程的实施,它允许从可在线可用的多个来源中整合排名的miRNA目标预测,并通过各种方法将它们汇总,从而提高预测质量以上任何一个来源。目前,可用于Homo Sapiens,Mus Musculus和Rattus Norvegicus(通过同源性翻译的最后一个)。

作者:Maciej Pajak,T。IanSimpson

维护者:T。Ian Simpson

引用(从r内,输入引用(“ mirnatap”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mirnatap”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ mirnatap”)

PDF R脚本 mirnatap
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 分类,,,,微阵列,,,,测序,,,,软件,,,,mirna
版本 1.22.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(6年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.3.0),AnnotationDbi
进口 DBI,,,,rsqlite,,,,Stringr,,,,SQLDF,,,,plyr, 方法
链接
建议 topgo,,,,org.hs.eg.db,,,,mirnatap.db,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我 mirnatap.db
进口我 mirnatap.db,,,,蜘蛛网
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 mirnatap_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 mirnatap_1.22.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) mirnatap_1.22.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mirnatap
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/mirnatap
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mirnatap/
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