miRLAB

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRLAB

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅miRLAB。

干实验室探索miRNA-mRNA关系

Bioconductor版本:3.11

提供工具探索miRNA-mRNA关系,包括流行的microrna的目标预测方法、整体集成单个方法的方法,功能从网络资源获取数据,进行功能验证的结果,和功能富集分析。

作者:Thuc Duy勒,Junpeng张莫陈,Vu Viet黄平君范教授

维护人员:Thuc Duy Le < Thuc。勒在unisa.edu.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“miRLAB”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“miRLAB”)

HTML	R脚本	miRLAB
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,网络,NetworkInference,软件,microrna的
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口	方法、统计跑龙套,RCurl,httr,stringr,Hmisc,能源,熵,Roleswitch,gplots,glmnet,嫁祸于,limma,pcalg,TCGAbiolinks,dplyr,SummarizedExperiment,ctc,heatmap.plus,InvariantCausalPrediction,类别,GOstats,org.Hs.eg.db
链接
建议	knitr,BiocGenerics,AnnotationDbi,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pvvhoang/miRLAB
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	miRLAB_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	miRLAB_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	miRLAB_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRLAB
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRLAB
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/miRLAB/
包下载报告	下载数据