此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见miRBaseConverter.
Bioconductor版本:3.11
一个全面的工具转换和检索miRNA名称,接入,序列,版本,历史和家族信息在不同的miRBase版本。它可以在短时间内处理大量的mirna,而不需要其他依赖。
作者:徐桃生<桃生。X在gmail.com>,Thuc Le
维护者:徐桃生<桃生。X在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“miRBaseConverter”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("miRBaseConverter")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“miRBaseConverter”)
超文本标记语言 | R脚本 | miRBaseConverter:一个全面、高效的工具,用于转换和检索不同miRBase版本的mirna信息 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件,microrna的 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(3年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.4) |
进口 | 统计数据 |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,RUnit,knitr,rtracklayer,跑龙套 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/taoshengxu/miRBaseConverter |
BugReports | https://github.com/taoshengxu/miRBaseConverter/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | miRBaseConverter_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | miRBaseConverter_1.12.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | miRBaseConverter_1.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRBaseConverter |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRBaseConverter |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/miRBaseConverter/ |
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