miRBaseConverter

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRBaseConverter

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见miRBaseConverter

一个全面和高效的工具,用于转换和检索不同miRBase版本的mirna信息

Bioconductor版本:3.11

一个全面的工具转换和检索miRNA名称,接入,序列,版本,历史和家族信息在不同的miRBase版本。它可以在短时间内处理大量的mirna,而不需要其他依赖。

作者:徐桃生<桃生。X在gmail.com>,Thuc Le

维护者:徐桃生<桃生。X在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“miRBaseConverter”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("miRBaseConverter")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“miRBaseConverter”)

超文本标记语言 R脚本 miRBaseConverter:一个全面、高效的工具,用于转换和检索不同miRBase版本的mirna信息
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 软件microrna的
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(3年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.4)
进口 统计数据
链接
建议 BiocGenericsRUnitknitrrtracklayer,跑龙套
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/taoshengxu/miRBaseConverter
BugReports https://github.com/taoshengxu/miRBaseConverter/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 miRBaseConverter_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 miRBaseConverter_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) miRBaseConverter_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRBaseConverter
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRBaseConverter
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/miRBaseConverter/
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