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methylCC
DOI:10.18129 / B9.bioc.methylCC
此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见methylCC．
估计DNA甲基化样本中全血的细胞组成
Bioconductor版本:3.11
在任何平台技术(微阵列和测序)上测量的DNA甲基化全血样本的细胞组成的估计工具。
作者:Stephanie C. Hicks [aut, cre]
，拉斐尔·伊里扎里[au]
维护者:Stephanie C. Hicks
引文(从R内，输入引用(“methylCC”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("methylCC")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“methylCC”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | methylCC用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DNAMethylation，MethylSeq，MethylationArray，微阵列，测序，软件，WholeGenome |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在Bioconductor | bio3.10 (R-3.6)(1年) |
| 许可证 | Cc乘4.0 |
| 取决于 | R (>= 3.6)，FlowSorted.Blood.450k |
| 进口 | Biobase，GenomicRanges，IRanges，S4Vectors，dplyr，magrittr，minfi，bsseq，quadprog，plyranges，统计，utils，bumphunter，genefilter、方法、IlluminaHumanMethylation450kmanifest，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，testthat(> =魅惑,BiocGenerics，BiocStyle，tidyr，ggplot2 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/stephaniehicks/methylCC/ |
| BugReports | https://github.com/stephaniehicks/methylCC/ |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | methylCC_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | methylCC_1.2.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | methylCC_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylCC |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/methylCC |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/methylCC/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
