mBPCR

DOI:10.18129 / B9.bioc.mBPCR

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅mBPCR。

贝叶斯分段常数回归进行DNA拷贝数的估计

Bioconductor版本:3.11

它包含函数估计的DNA拷贝数概要文件使用mBPCR,目的是检测拷贝数变化的地区。

作者:P.M.V. Rancoita < Rancoita。在gmail.com paola >,with contributions from M. Hutter

维护人员:P.M.V. Rancoita < Rancoita。在gmail.com paola >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“mBPCR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“mBPCR”)

PDF	R脚本	mBPCR
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation,微阵列,单核苷酸多态性,软件,aCGH
版本	1.42.0
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(11年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	oligoClasses,GWASTools
进口	Biobase、图形方法,跑龙套,grDevices
链接
建议	xtable
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.idsia.ch/ ~ paola / mBPCR
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	mBPCR_1.42.0.tar.gz
Windows二进制	mBPCR_1.42.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	mBPCR_1.42.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mBPCR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mBPCR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mBPCR/
包下载报告	下载数据