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illuminaio
DOI:10.18129 / B9.bioc.illuminaio
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅illuminaio。
解析Illumina公司微阵列输出文件
Bioconductor版本:3.11
工具解析Illumina公司的微阵列输出文件,包括IDAT。
作者:凯斯·巴格利(aut),亨利克·本特松(aut) Kasper丹尼尔·汉森(aut (cre),马特·里奇(aut),迈克·l·史密斯(aut)蒂姆Triche Jr .)(施)
维修工:Kasper丹尼尔·汉森< kasperdanielhansen gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“illuminaio”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“illuminaio”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“illuminaio”)
| 加密IDAT格式的描述 | ||
| R脚本 | 介绍illuminaio | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataImport,基础设施,微阵列,ProprietaryPlatforms,软件 |
| 版本 | 0.30.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(7.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | |
| 进口 | base64 |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics,IlluminaDataTestFiles(> = 1.0.2中),BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/HenrikBengtsson/illuminaio |
| BugReports | https://github.com/HenrikBengtsson/illuminaio/issues |
| 取决于我 | EGSEA123,normalize450K,RnBeads,西瓜 |
| 进口我 | beadarray,冠军,crlmm,ENmix,methylumi,minfi,芝麻 |
| 建议我 | limma |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | illuminaio_0.30.0.tar.gz |
| Windows二进制 | illuminaio_0.30.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | illuminaio_0.30.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/illuminaio |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ illuminaio |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/illuminaio/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
