H5VC
doi：10.18129/b9.bioc.h5vc
此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅H5VC。
使用HDF5后端管理对齐时间
生物导体版本：3.11
该软件包包含与HDF5文件中存储的NGS实验的TALLY数据交互的功能。
作者：Paul Theodor Pyl
维护者：paul theodor pyl
引用（从r内，输入引用（“ H5VC”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ h5vc”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ H5VC”）
| html | R脚本 | 用H5VC构建最小的基因组浏览器 |
| html | R脚本 | H5VC-游览 |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 软件 |
| 版本 | 2.22.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.13（R-3.0）（7年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | 网格，栅格，，，，GGPLOT2 |
| 进口 | RHDF5，，，，重塑，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，生物弦，，，，rsamtools（> = 1.99.1），方法，基因组机，，，，艾宾，，，，生物比较，，，，batchjobs，，，，H5VCDATA，，，，GenomeInfodB |
| 链接 | Rhtslib（> = 1.15.3） |
| 建议 | 尼特，，，，Locfit，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，Biomart，，，，bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38，，，，运行，，，，生物基因 |
| 系统要求 | gnu做 |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | H5VCDATA |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | h5vc_2.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | h5vc_2.22.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | h5vc_2.22.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/h5vc |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/h5vc |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/h5vc/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
