GeneFilter

doi：10.18129/b9.bioc.genefilter

此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅GeneFilter。

GeneFilter：高通量实验过滤基因的方法

生物导体版本：3.11

过滤基因的一些基本功能。

作者：R。Gentleman，V。Carey，W。Huber，F。Hahne

维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ GeneFilter”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ GeneFilter”）

PDF	R脚本	其他图：独立过滤增加了检测差异表达基因的功率，Bourgon等人，PNAS（2010）
PDF	R脚本	独立过滤的诊断
PDF	R脚本	如何找到表达谱类似于指定基因的基因
PDF	R脚本	使用GeneFilter函数从微阵列数据集过滤基因
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	微阵列，，，，软件
版本	1.70.0
在生物导体中	Bioc 1.6（R-2.1）或更早（> 15.5岁）
执照	艺术2.0
要看
进口	生物基因（> = 0.31.2），AnnotationDbi，，，，注释，，，，生物酶，图形，方法，统计，生存
链接
建议	班级，，，，HGU95AV2.DB，，，，tkwidgets，，，，全部，，，，鹏，，，，deseq，，，，帕西拉，，，，rcolorbrewer，，，，生物使用，，，，尼特
系统要求
增强
URL
取决于我	A4base，，，，CellHTS2，，，，cntools，，，，flowsorted.blood.epic，，，，Genemeta，，，，Hiiragi2013，，，，Maendtoend，，，，rnaseqgene，，，，简单，，，，Sispa，，，，SVA
进口我	Affyqcreport，，，，阿尔卑斯山，，，，Annmap，，，，ArrayQualityMetrics，，，，类别，，，，CBAF，，，，countsimqc，，，，covrna，，，，deseq，，，，deseq2，，，，dexseq，，，，Eisa，，，，enmix，，，，Exomepeak2，，，，GCMAP，，，，GGBASE，，，，GISPA，，，，GSRI，，，，ihwpaper，，，，接口，，，，甲基分析，，，，甲基接受，，，，甲基菌，，，，Minfi，，，，mlinterfaces，，，，莫格萨，，，，nbamseq，，，，PCAEXPLORER，，，，佩卡，，，，表，，，，pwrewas，，，，林戈，，，，rnainteractmapk，，，，简单，，，，蒂格拉里，，，，XDE，，，，Zinbwave
建议我	AffyExpress，，，，注释，，，，Arraytools，，，，生物探测，，，，Bionet，，，，BloodCancermultiomics2017，，，，类别Compare，，，，分类，，，，簇，，，，codelink，，，，可乐，，，，compcoder，，，，策划的布拉德达塔，，，，策展，，，，策展人，，，，延迟，，，，富集图，，，，事实设计，，，，FFPE，，，，ffpeexampledata，，，，Gagedata，，，，Genogam，，，，Genomicfiles，，，，gostats，，，，GSAR，，，，gsealm，，，，GSVA，，，，逻辑，，，，Lumi，，，，maqcsubset，，，，mcrestimate，，，，mmuphin，，，，NPGSEA，，，，奥利戈，，，，门索，，，，PVAC，，，，qpgraph，，，，rforpoteomics，，，，风湿性调节wollbold，，，，rtracklayer，，，，siggenes，，，，single.mtec.transcriptomes，，，，SSPA，，，，tcgabiolinks，，，，topgo
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	genefilter_1.70.0.tar.gz
Windows二进制	genefilter_1.70.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	genefilter_1.70.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genefilter
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/GenFilter
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/
软件包下载报告	下载统计