Geecc
doi：10.18129/b9.bioc.geecc
此软件包适用于3.11版的生物导体。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本，请参阅Geecc。
基因集富集分析扩展到应急立方
生物导体版本：3.11
使用对数线性模型对两个（基于应急表）或三个类别（应急立方）进行基因集富集进行超几何和卡方测试。类别可以是差异表达的基因，GO术语，序列长度，GC含量，染色体位置，系统层，差异 - strata，....
作者：马库斯·博恩（Markus Boenn）
维护者：Markus Boenn
引用（从r内，输入引用（“ geecc”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ geecc”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ geecc”）
| R脚本 | GEECC用户指南 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 生物问题，，，，去，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，免疫学，，，，微阵列，，，，rnaseq，，，，软件，，，，统计信息，，，，转录，，，，工作流程 |
| 版本 | 1.21.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（6年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.3.0），方法 |
| 进口 | 大量的，，，，超乳房（> = 1.3.0），GPLOTS，，，，RCPP（> = 0.11.3），图形，统计，utils |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | hgu133plus2.db，，，，go.db，，，，AnnotationDbi |
| 系统要求 | RCPP |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | geecc_1.21.0.tar.gz |
| Windows二进制 | geecc_1.21.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geecc |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/geecc |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/geecc/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
