GCAPC
doi：10.18129/b9.bioc.gcapc
此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅GCAPC。
GC意识到高峰呼叫者
生物导体版本：3.11
在测序读取中考虑了潜在的GC偏置，峰值要求芯片序列数据。首先，使用有效的GC策略估算GC偏置，然后使用一般的线性混合模型估算，然后应用于峰值显着性估计。
作者：Mingxiang Teng和Rafael A. Irizarry
维护者：mingxiang teng
引用（从r内，输入引用（“ GCAPC”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ gcapc”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ GCAPC”）
| html | R脚本 | GCAPC用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 批处理效应，，，，chipseq，，，，峰值探测，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.5（R-3.4）（3。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.4） |
| 进口 | 生物基因，，，，GenomeInfodB，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，基因组机，，，，rsamtools，，，，基因组签名，，，，矩阵，，，，大量的，花键，grdevices，图形，统计，方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/tengmx/gcapc |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | gcapc_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gcapc_1.12.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | gcapc_1.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gcapc |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/gcapc |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gcapc/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
