gQTLstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.gQTLstats

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅gQTLstats。

eQTL gQTLstats:计算效率分析和联合研究

Bioconductor版本:3.11

计算效率分析eQTL mQTL, dsQTL等等。

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“gQTLstats”)

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文档

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browseVignettes (“gQTLstats”)

HTML	R脚本	gQTLstats:统计遗传学基因组的功能
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文本		新闻

细节

biocViews	软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0),Homo.sapiens
进口	方法,snpStats,BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,GenomeInfoDb,GenomicFiles,GenomicRanges,SummarizedExperiment,VariantAnnotation,Biobase,BatchJobs,gQTLBase,limma,mgcv,dplyr,AnnotationDbi,GenomicFeatures,ggplot2,reshape2,doParallel,foreach,ffbase,BBmisc,beeswarm,HardyWeinberg、图表、数据、跑龙套,闪亮的,情节,erma,ggbeeswarm
链接
建议	geuvPack,geuvStore2,Rsamtools,knitr,rmarkdown,ggbio,BiocStyle,RUnit,乘,gwascat,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,ldblock
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	gwascat,parglms,yriMulti
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	gQTLstats_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	gQTLstats_1.20.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	gQTLstats_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gQTLstats
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gQTLstats
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gQTLstats/
包下载报告	下载数据