此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅Flowspecs。
生物导体版本:3.11
该软件包旨在填补传统的细胞术预处理软件的作用,用于光谱分解,转换,可视化和清理,并通过启用FlowFrames和Flovsets转换到DataFrames来帮助进一步的下游分析,例如Depecher。管线中的符合流库自动1D门控/过滤的功能。已经选择了包装名称,因为它将处理光谱细胞仪,并且希望能为用户提供一对漂亮的眼镜来查看其数据。
作者:Jakob Theorell [AUT,CRE]
维护者:jakob theorell
引用(从r内,输入引用(“ Flowspecs”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ flowspecs”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ flowspecs”)
html | R脚本 | 用于处理原始光谱细胞仪文件的示例工作流程 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 蜂窝基,,,,DataImport,,,,datarepresentation,,,,流程仪,,,,免疫学,,,,正常化,,,,Singlecell,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.10(R-3.6)(1年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 3.6) |
进口 | GGPLOT2(> = 3.1.0),生物基因(> = 0.30.0),生物比较(> = 1.18.1),RESHAPE2(> = 1.4.3),流核(> = 1.50.0),动物园(> = 1.8.6),Stats(> = 3.6.0),方法(> = 3.6.0) |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,流量,,,,Depecher |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/jtheorell/flowspecs/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | flowspecs_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | flowspecs_1.2.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | flowspecs_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/flowspecs |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/flowspecs |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/flowspecs/ |
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