此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅FCCAC。
生物导体版本:3.11
功能规范相关分析的应用来评估核酸测序数据集的协方差,例如染色质免疫沉淀,然后进行深层测序(CHIP-SEQ)。该软件包也可以与其他类型的测序数据一起使用,例如Nemerip-Seq(PMID:29489750),或以Bigwig格式提供的单细胞RNA-Seq或Epegenome数据。
作者:pedro madrigal
维护者:pedro madrigal
引用(从r内,输入引用(“ FCCAC”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ fccac”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ FCCAC”)
R脚本 | FCCAC小插图 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,遗传学,,,,测序,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(4年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.3.0),S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机, 网格 |
进口 | FDA,,,,rcolorbrewer,,,,基因组化,,,,GGPLOT2,,,,复杂的图像,grdevices,统计,utils |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物基因,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | fccac_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | FCCAC_1.14.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | FCCAC_1.14.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fccac |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/fccac |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/fccac/ |
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