FCCAC

doi:10.18129/b9.bioc.fccac

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅FCCAC

功能规范相关分析以评估核酸测序数据集之间的协方差

生物导体版本:3.11

功能规范相关分析的应用来评估核酸测序数据集的协方差,例如染色质免疫沉淀,然后进行深层测序(CHIP-SEQ)。该软件包也可以与其他类型的测序数据一起使用,例如Nemerip-Seq(PMID:29489750),或以Bigwig格式提供的单细胞RNA-Seq或Epegenome数据。

作者:pedro madrigal

维护者:pedro madrigal

引用(从r内,输入引用(“ FCCAC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ fccac”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ FCCAC”)

PDF R脚本 FCCAC小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,遗传学,,,,测序,,,,软件,,,,转录
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(4年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.3.0),S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机, 网格
进口 FDA,,,,rcolorbrewer,,,,基因组化,,,,GGPLOT2,,,,复杂的图像,grdevices,统计,utils
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 fccac_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 FCCAC_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) FCCAC_1.14.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fccac
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/fccac
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/fccac/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网