epivizrStandalone

DOI:10.18129 / B9.bioc.epivizrStandalone

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅epivizrStandalone。

在R运行Epiviz互动基因组数据可视化应用

Bioconductor版本:3.11

这个包导入epiviz JavaScript应用基因组数据可视化交互式可视化。epivizrServer的包是用来提供一个web服务器运行完全在r .这个独立的版本允许浏览任意基因组提供基因组注释Bioconductor包。

作者:赫克托耳Corrada布拉沃,Jayaram Kancherla

维修工:赫克托耳Corrada布拉沃< hcorrada gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“epivizrStandalone”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“epivizrStandalone”)

HTML		介绍epivizrStandalone
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GUI,基础设施,软件,可视化
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(4.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.2.3),epivizr(> = 2.3.6)方法
进口	git2r,epivizrServer,GenomeInfoDb,BiocGenerics,GenomicFeatures,S4Vectors
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,OrganismDbi(> = 1.13.9),Mus.musculus,Biobase,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	metavizr
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	epivizrStandalone_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	epivizrStandalone_1.16.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	epivizrStandalone_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrStandalone
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ epivizrStandalone
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/epivizrStandalone/
包下载报告	下载数据