epiNEM

DOI:10.18129 / B9.bioc.epiNEM

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见epiNEM．

epiNEM

Bioconductor版本:3.11

epiNEM是原始嵌套效应模型(NEM)的扩展。EpiNEM能够考虑双重敲除，并推断出更复杂的网络信号通路。

作者:Madeline Diekmann & Martin Pirkl

维护者:Martin Pirkl < Martin。Pirkl在bsse.ethz.ch>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("epiNEM")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“epiNEM”)

超文本标记语言	R脚本	epiNEM
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	网络，NetworkInference，通路，软件，SystemsBiology
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)
进口	BoolNet，e1071，gtools统计数据,igraph跑龙套,晶格，latticeExtra，RColorBrewer，pcalg，minetgrDevices,图，mnem
链接
建议	knitr，RUnit，BiocGenerics，STRINGdb，devtools，rmarkdown，GOSemSim，AnnotationHub，org.Sc.sgd.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	mnem
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	epiNEM_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	epiNEM_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	epiNEM_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epiNEM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/epiNEM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/epiNEM/
软件包下载报告	下载数据