富集

doi：10.18129/b9.bioc.enrichplot

此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅富集。

功能富集结果的可视化

生物导体版本：3.11

“富集”软件包实现了几种可视化方法，以解释从ORA或GSEA分析获得的功能富集结果。所有可视化方法都是基于“ GGPLOT2”图形开发的。

作者：广琴Yu [AUT，CRE]，Erqiang Hu [CTB]

维护者：gmail.com> guangchuang yu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ enrichplot”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“富集”）

html		富集
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，去，，，，基因烯，，，，kegg，，，，途径，，，，软件，，，，可视化
版本	1.8.1
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（2。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.4.0）
进口	AnnotationDbi，，，，牛仔图，，，，剂量（> = 3.13.1），EUROPEPMC，，，，GGPLOT2，，，，ggplotify，，，，ggraph，，，，Ggridges，，，，Gosemsim，图形，grdevices，网格，栅格，，，，Igraph， 方法，plyr，，，，purrr，，，，rcolorbrewer，，，，RESHAPE2，统计，utils，散落
链接
建议	clusterProfiler，，，，dplyr，，，，ggupset，，，，尼特，，，，org.hs.eg.db，，，，Prettydoc，，，，蒂布尔，，，，花花公子
系统要求
增强
URL	https://github.com/guangchuangyu/enrichplot
BugReports	https://github.com/guangchuangyu/enrichplot/issues
取决于我
进口我	Chipseeker，，，，clusterProfiler，，，，碎片器，，，，Mageckflute，，，，网眼，，，，Reactomepa
建议我	甲基
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	EnrichPlot_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	enrichplot_1.8.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	enrichplot_1.8.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enrichplot
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/enrichplot
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/enrichplot/
软件包下载报告	下载统计