eisa

DOI:10.18129 / B9.bioc.eisa

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见eisa．

通过迭代签名算法进行表达式数据分析

Bioconductor版本:3.11

迭代签名算法(ISA)是一种聚类方法;它在基因表达(或其他表格)数据中找到相关的块(转录模块)。ISA能够发现重叠模块，并具有抗噪声能力。这个包提供了一个方便的ISA接口，使用标准的BioConductor数据结构;并且还包含了各种可视化工具，可以与其他双聚类算法一起使用。

作者:Gabor Csardi < Csardi。Gabor在gmail.com>

维护者:Gabor Csardi < Csardi。Gabor在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("eisa")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes (eisa)

PDF	R脚本	基因表达数据的迭代签名算法
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类，GeneExpression，微阵列，软件，可视化
版本	1.40.0
在Bioconductor	BioC 2.6 (R-2.11)(10.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	isa2，Biobase(> = 2.17.8),AnnotationDbi、方法
进口	BiocGenerics，类别，genefilter，DBI
链接
建议	igraph(> = 0.6),矩阵，GOstats，GO.db，KEGG.db，biclust，质量，xtable，所有，hgu95av2.db，targetscan.Hs.eg.db，org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	ExpressionView
进口我	ExpressionView
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	eisa_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	eisa_1.40.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	eisa_1.40.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/eisa
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/eisa
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/eisa/
软件包下载报告	下载数据