截然不同的

DOI:10.18129 / B9.bioc.distinct

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见截然不同的

Distinct:一种通过层次排列测试进行差异分析的方法

Bioconductor版本:3.11

Distinct是一种统计方法,用于在两个或多个分布组之间进行差异测试;差分测试是通过对每个样本的累积分布函数(cdfs)进行分层非参数排列测试。虽然大多数差分表达方法的目标是条件之间平均丰度的差异,但通过比较完整的cdfs,可以同时识别涉及均值变化的差分模式,以及不涉及均值的更微妙的变化(例如,具有相同均值的单峰分布与双峰分布)。Distinct是一种通用且灵活的工具:由于其完全非参数性质,即不假设数据是如何生成的,因此它可以应用于各种数据集。它特别适合于对单细胞数据进行差异状态分析(即细胞亚群内的差异分析),如单细胞RNA测序(scRNA-seq)和高维流式或大规模细胞术(HDCyto)数据。要使用不同的样本,需要来自两组或两组以上样本(即实验条件)的数据,每组至少2个样本(即生物重复)。

作者:Simone Tiberi [aut, cre], Mark D. Robinson [aut]。

维护者:Simone Tiberi < Simone。提比利在uzh.ch>

引文(从R内,输入引用(“的”)):

安装

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如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("distinct")

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超文本标记语言 R脚本 Distinct:一种通过层次排列测试进行差异分析的方法
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文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionFlowCytometryGeneExpressionGeneTarget遗传学MultipleComparisonRNASeq测序SingleCell软件StatisticalMethod转录可视化
版本 1.0.4
在Bioconductor BioC 3.11 (R-4.0)(0.5年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R (>= 4.0)
进口 Rcpp统计数据,SummarizedExperimentSingleCellExperiment、方法、矩阵foreach平行,doParalleldoRNGggplot2limma
链接 RcppRcppArmadillo
建议 knitrtestthatUpSetR
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL https://github.com/SimoneTiberi/distinct
BugReports https://github.com/SimoneTiberi/distinct/issues
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包档案

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源包 distinct_1.0.4.tar.gz
Windows二进制 distinct_1.0.4.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) distinct_1.0.4.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/distinct
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/distinct
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/distinct/
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