diffcoexp

DOI:10.18129 / B9.bioc.diffcoexp

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅diffcoexp。

微分Co-expression分析

Bioconductor版本:3.11

识别不同的工具coexpressed链接(dcl)和不同coexpressed基因(DCGs系统)。dcl基因对有明显不同的两种条件下的相关系数。DCGs系统与偶然dcl明显多于基因。

作者:Wenbin魏,Sandeep Amberkar,温斯顿躲起来

维护人员:Wenbin魏< W。魏在sheffield.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“diffcoexp”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“diffcoexp”)

PDF	R脚本	关于diffcoexp
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道,DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,OneChannel,RNASeq,测序,软件,转录,TwoChannel
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(2.5年)
许可证	GPL (> 2)
取决于	R (> = 3.5),WGCNA,SummarizedExperiment
进口	统计数据,DiffCorr,心理,igraph,BiocGenerics
链接
建议	GEOquery
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hidelab/diffcoexp
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	diffcoexp_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	diffcoexp_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	diffcoexp_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffcoexp
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ diffcoexp
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/diffcoexp/
包下载报告	下载数据