cydar

DOI:10.18129 / B9.bioc.cydar

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见cydar

用质量细胞仪进行差异丰度分析

Bioconductor版本:3.11

在大规模细胞术数据中识别样本和组之间差异丰富的群体。提供用于将细胞计数为超球、控制空间错误发现率以及在高维标记空间中可视化丰度变化的方法。

作者:Aaron Lun [aut, cre]

维护者:Aaron Lun 的键盘

引文(从R内,输入引用(“cydar”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cydar")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“cydar”)

超文本标记语言 R脚本 差异丰度检测
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews FlowCytometryImmunoOncologyMultipleComparison蛋白质组学SingleCell软件
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(3.5年)
许可证 GPL-3
取决于 SingleCellExperiment
进口 冬青、方法、闪亮的,图形,统计,grDevices, utils,BiocGenericsS4VectorsBiocParallelSummarizedExperimentflowCoreBiobaseRcppBiocNeighbors
链接 Rcpp
建议 ncdfFlowtestthatknitr刨边机limmaglmnetBiocStyleflowStats
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 cydar_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 cydar_1.12.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) cydar_1.12.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cydar
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cydar
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cydar/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网