腰带
DOI:10.18129 / B9.bioc.cummeRbund
此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见腰带．
袖扣高通量测序数据的分析、探索、操作和可视化。
Bioconductor版本:3.11
允许持久存储，访问，探索，和操作袖扣高通量测序数据。此外，还为常用的可视化提供了许多绘图函数。
作者:L.戈夫，C.特拉普内尔，D.凯利
维护者:Loyal A. Goff
引文(从R内，输入引用(腰带))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cummeRbund")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(腰带)
| R脚本 | CummeRbund用户指南 | |
| R脚本 | 示例腰带工作流程 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 自述 | |
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 生物信息学，聚类，DataImport，DataRepresentation，DifferentialExpression，GeneExpression，HighThroughputSequencing，HighThroughputSequencingData，基础设施，MultipleComparisons，质量控制，RNAseq，RNAseqData，软件，可视化 |
| 版本 | 2.30.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(9年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 2.7.0)，BiocGenerics(> = 0.3.2),RSQLite，ggplot2，reshape2，fastcluster，rtracklayer，Gviz |
| 进口 | 方法,plyr，BiocGenerics，S4Vectors(> = 0.9.25),Biobase |
| 链接 | |
| 建议 | 集群，plyr，NMFN，stringr，GenomicFeatures，GenomicRanges，rjson |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | meshr |
| 建议我 | IsoformSwitchAnalyzeR |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | cummeRbund_2.30.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cummeRbund_2.30.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | cummeRbund_2.30.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cummeRbund |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cummeRbund |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cummeRbund/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
