此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见cqn.
Bioconductor版本:3.11
一种用于RNA-Seq数据的归一化工具,实现条件分位数归一化方法。
作者:吴志金,Kasper Daniel Hansen
维护者:Kasper Daniel Hansen
引文(从R内,输入引用(“cqn”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cqn")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“cqn”)
R脚本 | CQN(条件分位数规范化) | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,ImmunoOncology,预处理,RNASeq,软件 |
版本 | 1.34.0 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(9年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10.0),mclust,nor1mix统计数据,preprocessCore样条函数,quantreg |
进口 | 样条函数 |
链接 | |
建议 | 尺度,刨边机 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | exomePeak2,KnowSeq |
进口我 | tweeDEseq |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | cqn_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | cqn_1.34.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | cqn_1.34.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cqn |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cqn |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cqn/ |
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