countsimQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.countsimQC

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅countsimQC。

比较统计数据集的特征

Bioconductor版本:3.11

countsimQC提供功能来创建一个全面的报告比较广泛的跨数的集合特征矩阵。一个重要的用例是一个或多个合成数矩阵的比较实际数矩阵,这也许是一个潜在的模拟。然而,任何数矩阵可以比较的集合。

作者:夏洛特Soneson (aut (cre)

维护人员:夏洛特Soneson < charlottesoneson gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“countsimQC”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“countsimQC”)

HTML	R脚本	countsimQC用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentalDesign,ImmunoOncology,微生物组,质量控制,RNASeq,ReportWriting,SingleCell,软件,可视化
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(2年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.5)
进口	rmarkdown(> = 0.9.5),刨边机,DESeq2(> = 1.16.0),dplyr,tidyr,ggplot2,grDevices,工具,SummarizedExperiment,genefilter,DT,GenomeInfoDbData,caTools,randtests统计,跑龙套的方法
链接
建议	knitr,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/csoneson/countsimQC
BugReports	https://github.com/csoneson/countsimQC/issues
取决于我
进口我
建议我	马斯喀特
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	countsimQC_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	countsimQC_1.6.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	countsimQC_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/countsimQC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ countsimQC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/countsimQC/
包下载报告	下载数据