此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见结合.
Bioconductor版本:3.11
结合准似然估计、复合回归模型和潜变量模型,对多个组学数据集进行综合可视化。无约束和有约束积分均可用,结果显示为可解释的多图。
作者:Stijn Hawinkel < Stijn。Hawinkel在ugent, be>
维护者:Joris Meys < Joris。Meys at ugent.be>
引文(从R内,输入引用(“联合”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("combi")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“联合”)
超文本标记语言 | R脚本 | combi包手册 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DimensionReduction,代谢组学,宏基因组,微生物组,软件,可视化 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.11 (R-4.0)(0.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | ggplot2,nleqslv,phyloseq,张量统计数据,limma,矩阵,BB,reshape2,阿拉巴马州,玉米穗轴,Biobase,素食主义者, grDevices,图形,方法,SummarizedExperiment |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/CenterForStatistics-UGent/combi/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | combi_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | combi_1.0.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | combi_1.0.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/combi |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/combi |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/combi/ |
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