chroGPS

DOI:10.18129 / B9.bioc.chroGPS

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.11版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅chroGPS。

chroGPS2:一代,可视化和微分分析表观基因组地图

Bioconductor版本:3.11

我们提供直观的地图可视化、分析和比较了基于表观遗传基因元素之间的联系资料。这种方法是基于多维扩展,包括处理高维数据集的并行实现。我们提供一些合理的距离度量,和调整程序来消除系统偏差通常观察到当合并获得的数据在不同的技术或基因背景。我们还提供函数和方法的表观基因组地图进行微分分析因素和基因水平。

作者:奥斯卡雷纳,大卫Rossell

维护人员:奥斯卡雷纳<奥斯卡。雷纳在irbbarcelona.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“chroGPS”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,ChIPchip,聚类,DataRepresentation,表观遗传学,HistoneModification,ImmunoOncology,软件,可视化
版本	2.6.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(8年)
许可证	GPL (> = 2.14)
取决于	R (> = 3.2.0),GenomicRanges,IRanges、方法、Biobase,质量、图表、数据、changepoint
进口	集群DPpackage,ICSNP,椭圆,素食主义者
链接
建议
SystemRequirements
增强了	平行,XML,rgl,gplots,pheatmap,ChIPpeakAnno,org.Dm.eg.db,caTools,情节
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chroGPS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ chroGPS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chroGPS/
包下载报告	下载数据