这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅chimeraviz。
Bioconductor版本:3.11
chimeraviz管理数据融合基因发现者和提供有用的可视化工具。
作者:Stian Lagstad (aut (cre)森赵(施),安德烈亚斯·m·霍夫(施),Bjarne Johannessen[所有],Ole基督教Lingjærde[所有],Rolf Skotheim(施)
维护人员:Stian Lagstad < stianlagstad gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“chimeraviz”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“chimeraviz”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“chimeraviz”)
HTML | R脚本 | chimeraviz |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 对齐,基础设施,软件 |
版本 | 1.14.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biostrings,GenomicRanges,IRanges,Gviz,S4Vectors,ensembldb,AnnotationFilter,data.table |
进口 | 方法、网格Rsamtools,GenomeInfoDb,GenomicAlignments,RColorBrewer、图形、AnnotationDbi,RCircos,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,rmarkdown,图,Rgraphviz,DT,plyr,dplyr,BiocStyle,ArgumentCheck,gtools,魔法 |
链接 | |
建议 | testthat,roxygen2,devtools,knitr,lintr |
SystemRequirements | 领结,samtools egrep所需的一些功能 |
增强了 | |
URL | https://github.com/stianlagstad/chimeraviz |
BugReports | https://github.com/stianlagstad/chimeraviz/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | chimeraviz_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | chimeraviz_1.14.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimeraviz |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ chimeraviz |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/chimeraviz/ |
包下载报告 | 下载数据 |