ccrepe

DOI:10.18129 / B9.bioc.ccrepe

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ccrepe

ccrepe_and_nc.score

Bioconductor版本:3.11

CCREPE(纠正REnormalizaion和排列组合性原则)包的目的是评估的意义一般相似措施组成的数据集。在微生物丰度数据,例如,所有微生物和总丰度;CCREPE设计时考虑到这个约束假定值分配给微生物之间的相似性度量。包有两个功能:ccrepe:计算相似性措施,p和q值的相对含量,虫子在身体一个或两个网站的使用引导和置换矩阵的数据。数控。得分:计算了解共变和co-exclusion模式基于棋盘得分顺序数据的扩展。

作者:艾玛Schwager < emh146 mail.harvard.edu >,克雷格·比<克雷格。乔治·比gmail.com >,乔治Weingart <。在gmail.com weingart >

维护人员:艾玛Schwager <艾玛。schwager gmail.com >,克雷格·比<克雷格。乔治·比gmail.com >,乔治Weingart <。在gmail.com weingart >

从内部引用(R,回车引用(“ccrepe”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ccrepe”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF R脚本 ccrepe
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 生物信息学,ImmunoOncology,宏基因组,软件,统计数据
版本 1.24.0
Bioconductor自 BioC 2.14 (r - 3.1)(6.5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口 infotheo(> = 1.1)
链接
建议 knitr,BiocStyle,BiocGenerics,testthat
SystemRequirements
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ccrepe_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 ccrepe_1.24.0.zip
macOS 10.13(高山脉) ccrepe_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ccrepe
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ccrepe
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ccrepe/
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