这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cbaf。
Bioconductor版本:3.11
这个包包含函数,使分析和比较数据跨各种肿瘤/癌症使子组。到目前为止,它是与RNA-seq兼容,microRNA-seq,微阵列和甲基化数据集存储在cbioportal.org。
作者:阿曼Shahrisa (aut、cre cph], Maryam塔玛色比Birgani (aut)
维护人员:阿曼Shahrisa < Shahrisa。阿曼在hotmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“cbaf”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cbaf”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“cbaf”)
HTML | R脚本 | cbaf |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | AssayDomain,BiomedicalInformatics,ComparativeGenomics,DNAMethylation,表观遗传学,GeneExpression,遗传学,ResearchField,软件,转录,转录组 |
版本 | 1.10.1 |
Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(3年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.5.0) |
进口 | BiocFileCache,RColorBrewer,cgdsr,genefilter,gplots,统计grDevices跑龙套,xlsx |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | cbaf_1.10.1.tar.gz |
Windows二进制 | cbaf_1.10.1.zip |
macOS 10.13(高山脉) | cbaf_1.10.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbaf |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cbaf |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cbaf/ |
包下载报告 | 下载数据 |