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分歧点
DOI:10.18129 / B9.bioc.branchpointer
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅分歧点。
预测intronic拼接分歧点
Bioconductor版本:3.11
概率预测分歧点intronic分歧点windows的网站。查询可以提供intronic地区;或评估突变的影响,单核苷酸多态性。
作者:贝丝信号
维护人员:贝丝信号< b。信号在garvan.org.au >
从内部引用(R,回车引用(“分歧点”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“分歧点”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“分歧点”)
| R脚本 | 使用注释intronic人类拼接branchpoints分歧点 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | GenomeAnnotation,GenomicVariation,MotifAnnotation,软件 |
| 版本 | 1.14.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(3.5年) |
| 许可证 | BSD_3_clause +文件许可证 |
| 取决于 | 脱字符号R (> = 3.4) |
| 进口 | plyr,kernlab,“绿带运动”,stringr,cowplot,ggplot2,biomaRt,Biostrings平行,跑龙套,统计数据,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,rtracklayer,GenomicRanges,GenomeInfoDb,IRanges,S4Vectors,data.table |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | branchpointer_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | branchpointer_1.14.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | branchpointer_1.14.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/branchpointer |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/分歧点 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/branchpointer/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
