birta

DOI:10.18129 / B9.bioc.birta

此包适用于Bioconductor 3.11版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见birta．

转录活性调控的贝叶斯推断

Bioconductor版本:3.11

mRNA分子的表达水平受到不同过程的调控，包括转录因子的抑制或激活以及microRNAs的转录后降解。birta(转录活性调控贝叶斯推断)使用tf和miRNA的调控网络以及mRNA和miRNA表达数据来预测两种条件之间调控活性的切换。采用贝叶斯网络对调控结构进行建模，采用马尔可夫链-蒙特卡罗对活动状态进行采样。

作者:Benedikt Zacher, Khalid Abnaof, Stephan Gade, Erfan Younesi, Achim Tresch, Holger Froehlich

维护者:Benedikt Zacher < Zacher at lmb.uni-muenchen.de>， Holger Froehlich

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("birta")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“birta”)

PDF	R脚本	转录活性调控的贝叶斯推断
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GraphAndNetwork，微阵列，测序，软件，转录
版本	1.31.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(8.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	limma，质量， r (>= 2.10)，Biobase、方法
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	birta_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	birta_1.31.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/birta
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/birta
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/birta/
软件包下载报告	下载数据