BIOSVD
doi：10.18129/b9.bioc.biosvd
此软件包适用于3.11版的生物导体。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本，请参阅BIOSVD。
用于高通量数据处理，异常检测，降噪和动态建模的软件包
生物导体版本：3.11
BIOSVD软件包包含功能，以将输入数据集从特征X分析空间减少到降低的对角线特征Feature X Eigenassay空间，分别具有特征性和特征的特征和特征的特征和分别的特征正常序列。随后可以根据生成的图表检查应用于数据的SVD的结果，例如本征feature X Assay矩阵的热图和所有特征性特征分数的条形图。这些图有助于确定要滤除哪些特征和特征的特征（即，代表稳态，噪声或实验伪影的特征表；或应用于数据方差时，代表稳定尺度差异的特征表）。在可能删除稳态表达，稳态差异，噪声和实验伪影以及将SVD重新应用于归一化数据之后，生成了本本特征系统的摘要HTML报告，其中包含包括测定和特征的极性图，以及其他特征图，一张具有根据其坐标，半径和相位相位的特征列表的表格，以及根据提供的两个选定的特征表和具有彩色功能/测定注释信息的特征分类的数据的可视化数据。这给出了表达/强度水平的动力学的全局图，其中单个特征和测定被分类为相似的调节和功能或类似的细胞状态和生物学表型的组。
作者：gene.com上的Anneleen Daemen
维护者：gene.com上的Anneleen Daemen
引用（从r内，输入引用（“ BioSVD”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ biosvd”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ BioSVD”）
| R脚本 | BIOSVD | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 软件，，，，时间科，，，，可视化 |
| 版本 | 2.23.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（6。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.1.0） |
| 进口 | 生物基因，，，，生物酶，方法，网格，图形，NMF |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | biosvd_2.23.0.tar.gz |
| Windows二进制 | biosvd_2.23.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biosvd |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/bioSVD |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/biosvd/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
