此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见biobroom.
Bioconductor版本:3.11
这个包包含转换生物信息学包构造的标准对象的方法,特别是那些在Bioconductor中的对象,并将它们转换为整齐的数据。因此,它是扫帚包的补充,并遵循相同的整理方法,增加,扫分。整理数据使得重组、重塑和可视化生物信息学分析变得容易。
作者:Andrew J. Bass, David G. Robinson, Steve Lianoglou, Emily Nelson, John D. Storey,由Laurent Gatto贡献
维护者:John D. Storey
引文(从R内,输入引用(“biobroom”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“biobroom”)
超文本标记语言 | R脚本 | 装饰图案的标题 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,MultipleComparison,蛋白质组学,回归,软件 |
版本 | 1.20.0 |
在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(5年) |
许可证 | LGPL |
取决于 | R (>= 3.0.0),扫帚 |
进口 | dplyr,tidyr,Biobase |
链接 | |
建议 | limma,DESeq2,气道,ggplot2,plyr,GenomicRanges,testthat,magrittr,刨边机,qvalue,knitr,data.table,MSnbase,SummarizedExperiment |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/StoreyLab/biobroom |
BugReports | https://github.com/StoreyLab/biobroom/issues |
全靠我 | |
进口我 | 泛太平洋伙伴关系 |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | biobroom_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | biobroom_1.20.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | biobroom_1.20.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biobroom |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/biobroom |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/biobroom/ |
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