bigmemoryExtras

DOI:10.18129 / B9.bioc.bigmemoryExtras

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见bigmemoryExtras。

对大内存包的扩展，增加了安全性、便捷性和一个因子类

Bioconductor版本:3.11

这个包定义了一个“BigMatrix”ReferenceClass，它为bigmemory包中的file - back .big.matrix类添加了安全和方便的特性。BigMatrix通过监视和优雅地恢复到磁盘数据的连接来防止段错误，它还通过基于文件系统的权限系统防止意外的数据修改。我们提供了在Biobase包的eSet类家族中使用bigmatrix派生类作为assayData矩阵的实用程序。BigMatrix提供了一些与附加到带有dimnames的文件支持矩阵和索引相关的优化。此外，该包还提供了一个“BigMatrixFactor”类，这是一个带有因子属性的文件支持矩阵。

作者:Peter M. Haverty

维持者:Peter M. Haverty

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("bigmemoryExtras")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation,基础设施,软件
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (R-2.15)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.12),bigmemory(> = 4.5.31)
进口	方法
链接
建议	testthat,BiocGenerics,BiocStyle,knitr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/phaverty/bigmemoryExtras
取决于我
进口我	gCMAP
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	bigmemoryExtras_1.36.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	bigmemoryExtras_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigmemoryExtras
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bigmemoryExtras
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bigmemoryExtras/
包下载报告	下载数据