Beadarray
doi：10.18129/b9.bioc.beadarray
此软件包适用于3.11版的生物导体；对于稳定的最新版本，请参阅Beadarray。
Illumina Beadarray数据的质量评估和低级分析
生物导体版本：3.11
该软件包能够读取BeadScan输出的珠级数据（原始TIFFS和文本文件）以及Beadstudio的珠子 - 萨华数据。提供了质量评估和低级分析的方法。
作者：马克·邓宁，迈克·史密斯，乔纳森·凯恩斯，安迪·林奇，马特·里奇
维护者：Mark Dunning
引用（从r内，输入引用（“ Beadarray”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ beadarray”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Beadarray”）
| R脚本 | beadarray.pdf | |
| R脚本 | Beadlevel.pdf | |
| R脚本 | Beadsummary.pdf | |
| R脚本 | ImageProcessing.pdf | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 微阵列，，，，Onechannel，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，软件 |
| 版本 | 2.38.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 1.8（R-2.3）（14。5年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | r（> = 2.13.0），生物基因（> = 0.3.2），生物酶（> = 2.17.8），Hexbin |
| 进口 | Beaddatapackr，，，，林玛，，，，AnnotationDbi，stats4，RESHAPE2，，，，基因组机，，，，iranges，，，，Illuminaio， 方法，GGPLOT2 |
| 链接 | |
| 建议 | Lumi，，，，VSN，，，，副词，，，，HWRITER，，，，Beadarrayexampledata，，，，Illuminahumanv3.db，，，，栅格，，，，生物使用，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，GGBIO，，，，喷嘴.r1，，，，尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | Beadarrayexampledata |
| 进口我 | ArrayQualityMetrics，，，，Beadarrayusecases，，，，Blima，，，，Epgenomix |
| 建议我 | Beadarraysnp，，，，blimatestingdata，，，，Lumi |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | beadarray_2.38.0.tar.gz |
| Windows二进制 | beadarray_2.38.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | Beadarray_2.38.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beadarray |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/beadarray |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/beadarray/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
