atSNP

DOI:10.18129 / B9.bioc.atSNP

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅atSNP

亲和力测试确定监管snp

Bioconductor版本:3.11

atSNP执行关联测试的主题匹配SNP或参考基因组和SNP-led相契合的变化。

作者:钱德勒左(aut) Sunyoung胫骨(aut (cre) Sunduz凯尔(aut)

维护人员:Sunyoung Shin < Sunyoung。shin utdallas.edu >

从内部引用(R,回车引用(“atSNP”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“atSNP”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“atSNP”)

HTML R脚本 atsnp-vignette.html
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeq,GenomeAnnotation,MotifAnnotation,软件,可视化
版本 1.3.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (r - 3.6)(1.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 3.6)
进口 BSgenome,BiocFileCache,BiocParallel,Rcpp,data.table,ggplot2、grDevices、图形、网格motifStack,rappdirs统计数据,testit,跑龙套
链接 Rcpp
建议 testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/sunyoungshin/atSNP
BugReports https://github.com/sunyoungshin/atSNP/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 atSNP_1.3.0.tar.gz
Windows二进制 atSNP_1.4.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) atSNP_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/atSNP
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ atSNP
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/atSNP/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网