此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅apeglm。
生物导体版本:3.11
APEGLM使用单个系数的后端近似为各种GLM模型提供贝叶斯收缩估计量。
作者:Anqi Zhu [Aut,Cre],Joshua Zitovsky [CTB],Joseph Ibrahim [AUT],Michael Love [AUT]
维护者:anqi Zhu
引用(从r内,输入引用(“ apeglm”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ apeglm”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ apeglm”)
html | R脚本 | APEGLM的效果尺寸估计 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 贝叶斯,,,,差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(3年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | |
进口 | emdbook,,,,总结性特征,,,,基因组机,方法,统计,utils,RCPP |
链接 | RCPP,,,,rcppeigen,,,,rcppnumerical |
建议 | deseq2,,,,呼吸道,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | rnaseqgene |
进口我 | Exomepeak2 |
建议我 | Brgenomics,,,,deseq2,,,,鱼池 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | apeglm_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | apeglm_1.10.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | apeglm_1.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/apeglm |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/apeglm |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/apeglm/ |
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