apeglm

doi:10.18129/b9.bioc.apeglm

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅apeglm

GLM系数的近似后验估计

生物导体版本:3.11

APEGLM使用单个系数的后端近似为各种GLM模型提供贝叶斯收缩估计量。

作者:Anqi Zhu [Aut,Cre],Joshua Zitovsky [CTB],Joseph Ibrahim [AUT],Michael Love [AUT]

维护者:anqi Zhu

引用(从r内,输入引用(“ apeglm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ apeglm”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ apeglm”)

html R脚本 APEGLM的效果尺寸估计
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(3年)
执照 GPL-2
要看
进口 emdbook,,,,总结性特征,,,,基因组机,方法,统计,utils,RCPP
链接 RCPP,,,,rcppeigen,,,,rcppnumerical
建议 deseq2,,,,呼吸道,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我 rnaseqgene
进口我 Exomepeak2
建议我 Brgenomics,,,,deseq2,,,,鱼池
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 apeglm_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 apeglm_1.10.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) apeglm_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/apeglm
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/apeglm
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/apeglm/
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