annaffy

DOI:10.18129 / B9.bioc.annaffy

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅annaffy。

Affymetrix生物元数据注释工具

Bioconductor版本:3.11

函数用于处理数据从Bioconductor Affymetrix注释数据包。产生紧凑的HTML和文本报告包括实验数据和许多在线数据库URL链接。允许搜索生物元数据使用不同的标准。

作者:科林·a·史密斯<科林colinsmith.org >

维护人员:科林·a·史密斯<科林colinsmith.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“annaffy”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“annaffy”)

PDF	R脚本	annaffy底漆
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释,去,微阵列,OneChannel,通路,ReportWriting,软件
版本	1.60.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 15.5年)
许可证	LGPL
取决于	R(> = 2.5.0)、方法Biobase,GO.db,KEGG.db
进口	AnnotationDbi(> = 0.1.15),DBI
链接
建议	hgu95av2.db,乘,tcltk
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	a4Base,a4Reporting,PGSEA,webbioc
进口我
建议我	AffyExpress,ArrayTools,BiocCaseStudies
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	annaffy_1.60.0.tar.gz
Windows二进制	annaffy_1.60.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	annaffy_1.60.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annaffy
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ annaffy
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/annaffy/
包下载报告	下载数据