这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅alevinQC。
Bioconductor版本:3.11
生成QC报告总结一个小鲑鱼运行的输出。报告可以生成html或pdf文件,或闪闪发光的应用程序。
作者:夏洛特Soneson (aut (cre)Avi,斯利瓦斯塔瓦(aut)
维护人员:夏洛特Soneson < charlottesoneson gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“alevinQC”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“alevinQC”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“alevinQC”)
HTML | R脚本 | alevinQC |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 质量控制,SingleCell,软件 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(1.5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.6) |
进口 | rmarkdown、工具、方法ggplot2,GGally,dplyr,rjson,闪亮的,shinydashboard,DT,统计,跑龙套,tximport(> = 1.11.5),cowplot,rlang |
链接 | |
建议 | knitr,BiocStyle,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/csoneson/alevinQC |
BugReports | https://github.com/csoneson/alevinQC/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | alevinQC_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | alevinQC_1.4.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | alevinQC_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alevinQC |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ alevinQC |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/alevinQC/ |
包下载报告 | 下载数据 |