affyQCReport

DOI:10.18129 / B9.bioc.affyQCReport

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅affyQCReport。

为affyBatch对象QC报告生成

Bioconductor版本:3.11

这个包为一个AffyBatch对象创建一份质检报告。这份报告的目的是允许用户快速评估的质量一组在一个AffyBatch对象数组。

作者:克雷格Parman <克雷格。在bifx.org parman >,Conrad Halling , Robert Gentleman

维护人员:克雷格Parman <克雷格。在bifx.org parman >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“affyQCReport”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“affyQCReport”)

PDF	R脚本	affyQCReport:生成Affymetrix QC报告的方法
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,OneChannel,质量控制,软件
版本	1.66.0
Bioconductor自	BioC 1.7 (r - 2.2)(15年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	Biobase(> = 1.13.16),affy,晶格
进口	affy,affyPLM,Biobase,genefilter、图形、grDevices晶格,RColorBrewer,simpleaffy,统计,跑龙套,xtable
链接
建议	tkWidgets(> = 1.5.23),affydata(> = 1.4.1)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	BiocCaseStudies
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	affyQCReport_1.66.0.tar.gz
Windows二进制	affyQCReport_1.66.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	affyQCReport_1.66.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affyQCReport
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ affyQCReport
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/affyQCReport/
包下载报告	下载数据