affyILM

DOI:10.18129 / B9.bioc.affyILM

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅affyILM

线性模型的背景减法和朗缪尔等温线

Bioconductor版本:3.11

affyILM是一个预处理工具估计Affymetrix基因芯片的基因表达水平。从物理化学是用来输入第一背景减强度之前计算浓度代表朗缪尔模型。

作者:k . Myriam Kroll法布里斯·伯杰,杰拉德Barkema Enrico Carlon

维护人员:Myriam Kroll和法布里斯·伯杰<法布里斯。伯杰在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“affyILM”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“affyILM”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“affyILM”)

PDF R脚本 affyILM1.3.0
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列,OneChannel,预处理,软件
版本 1.40.0
Bioconductor自 BioC 2.6 (r - 2.11)(10.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R(> = 2.10.0)、方法gcrma
进口 affxparser(> = 1.16.0),affy、图形、Biobase
链接
建议 AffymetrixDataTestFiles,hgfocusprobe
SystemRequirements
增强了