txreginfra

doi:10.18129/b9.bioc.txreginfra

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅txreginfra

转录监管网络多构规范的元数据管理

生物导体版本:3.11

该软件包为监管网络创建中采用的基因组元数据提供了界面,重点是NOSQL解决方案。目前使用侵略性Perexperiment API的eqtls,DNasei超敏反应位点和数字基因组足迹的定量表示。

作者:文斯·凯里

维护者:vj Carey

引用(从r内,输入引用(“ txreginfra”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ txreginfra”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ txreginfra”)

html R脚本 Txreginfra中的垫片
html R脚本 TXREGINFRA- TXREGQUERY的类和方法
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 网络,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(2。5年)
执照 艺术2.0
依靠 r(> = 3.5),破烂的经历(> = 1.3.11),蒙古石
进口 方法,rjson,,,,基因组机,,,,iranges,,,,生物比较,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS,,,,总结性特征,UTILS
链接
建议 尼特,,,,Genomicfiles,,,,ensdb.hsapiens.v75,,,,测试,,,,闪亮的,,,,Biovizbase(> = 1.27.2),GVIZ,,,,AnnotationFilter,,,,Ensembldb,,,,Ontoproc,,,,rjson,,,,图形,,,,tfutils(> = 1.5.4)
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 txreginfra_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 txreginfra_1.8.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) txreginfra_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/txreginfra
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/txreginfra
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/txreginfra/
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