此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅txreginfra。
生物导体版本:3.11
该软件包为监管网络创建中采用的基因组元数据提供了界面,重点是NOSQL解决方案。目前使用侵略性Perexperiment API的eqtls,DNasei超敏反应位点和数字基因组足迹的定量表示。
作者:文斯·凯里
维护者:vj Carey
引用(从r内,输入引用(“ txreginfra”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ txreginfra”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ txreginfra”)
html | R脚本 | Txreginfra中的垫片 |
html | R脚本 | TXREGINFRA- TXREGQUERY的类和方法 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 网络,,,,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(2。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
依靠 | r(> = 3.5),破烂的经历(> = 1.3.11),蒙古石 |
进口 | 方法,rjson,,,,基因组机,,,,iranges,,,,生物比较,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS,,,,总结性特征,UTILS |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,Genomicfiles,,,,ensdb.hsapiens.v75,,,,测试,,,,闪亮的,,,,Biovizbase(> = 1.27.2),GVIZ,,,,AnnotationFilter,,,,Ensembldb,,,,Ontoproc,,,,rjson,,,,图形,,,,tfutils(> = 1.5.4) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | txreginfra_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | txreginfra_1.8.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | txreginfra_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/txreginfra |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/txreginfra |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/txreginfra/ |
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