TargetScore

DOI:10.18129 / B9.bioc.TargetScore

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TargetScore

TargetScore:使用microRNA过表达数据和序列信息推断microRNA目标

Bioconductor版本:3.11

通过概率模拟microRNA过表达折叠变化的可能性和基于序列的分数,推断microRNA目标的后验分布。采用变向贝叶斯高斯混合模型(VB-GMM)记录折叠变化和序列分数,得到潜在变量作为miRNA靶标的后验。最终的targetScore计算为sigmoid转换的折叠变化,由所有特征的目标组件的平均后视进行加权。

作者:李越

维护者:Yue Li

引文(从R内,输入引用(“TargetScore”)):

安装

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如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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文档

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browseVignettes(“TargetScore”)

PDF R脚本 TargetScore:使用microRNA过表达数据和序列信息推断microRNA目标
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文本 新闻

细节

biocViews 软件microrna的
版本 1.26.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(7年)
许可证 GPL-2
取决于 pracma矩阵
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建议 TargetScoreDatagplotsBiobaseGEOquery
SystemRequirements
增强了
URL http://www.cs.utoronto.ca/~yueli/software.html
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包档案

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源包 TargetScore_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 TargetScore_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) TargetScore_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TargetScore
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TargetScore
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TargetScore/
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