TargetScore

DOI:10.18129 / B9.bioc.TargetScore

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见TargetScore．

TargetScore:使用microRNA过表达数据和序列信息推断microRNA目标

Bioconductor版本:3.11

通过概率模拟microRNA过表达折叠变化的可能性和基于序列的分数，推断microRNA目标的后验分布。采用变向贝叶斯高斯混合模型(VB-GMM)记录折叠变化和序列分数，得到潜在变量作为miRNA靶标的后验。最终的targetScore计算为sigmoid转换的折叠变化，由所有特征的目标组件的平均后视进行加权。

作者:李越

维护者:Yue Li

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TargetScore”)

PDF	R脚本	TargetScore:使用microRNA过表达数据和序列信息推断microRNA目标
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件，microrna的
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(7年)
许可证	GPL-2
取决于	pracma，矩阵
进口
链接
建议	TargetScoreData，gplots，Biobase，GEOquery
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cs.utoronto.ca/~yueli/software.html
全靠我
进口我
建议我	TargetScoreData
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	TargetScore_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	TargetScore_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	TargetScore_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TargetScore
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TargetScore
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TargetScore/
软件包下载报告	下载数据