TTMap

DOI:10.18129 / B9.bioc.TTMap

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TTMap

Two-Tier Mapper:基于拓扑数据分析的聚类工具

Bioconductor版本:3.11

TTMap是一种聚类方法,将与对照组相比具有相同偏差的样本分组在一起。当数据很小时,它特别有用。它是无参数的。

作者:Rachel Jeitziner

维护者:Rachel Jeitziner < Rachel。Jeitziner在epfl.ch>

引文(从R内,输入引用(“TTMap”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("TTMap")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TTMap”)

PDF R脚本 TTMap库的手册
PDF 参考手册

细节

biocViews 分类聚类DifferentialExpression微阵列MultipleComparison软件
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(2.5年)
许可证 GPL-2
取决于 rglcolorRamps
进口 grDevices,图形,统计,utils,方法,SummarizedExperimentBiobase
链接
建议 BiocStyle气道
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 TTMap_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 TTMap_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) TTMap_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TTMap
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TTMap
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TTMap/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网