DOI:10.18129 / B9.bioc.TIN

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅

转录组不稳定分析

Bioconductor版本:3.11

锡包实现了一套基于外显子表达谱的转录组不稳定分析的工具。偏离使用外显子剪接的上下文中研究转录组分析到什么程度不稳定因素与剪接因子表达式。在转录组不稳定相关分析,数据比较的随机排列可变剪接的分数和表达随机基因集。

作者:Bjarne Johannessen,安妮塔Sveen和罗尔夫。Skotheim

维护人员:Bjarne Johannessen < bjajoh在rr-research.no >

从内部引用(R,回车引用(“锡”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“锡”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“锡”)

PDF R脚本 介绍了锡包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicing,DifferentialSplicing,ExonArray,GeneExpression,遗传学,微阵列,软件
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (r - 3.2)(5.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.12.0),data.table,嫁祸于,aroma.affymetrix
进口 WGCNA,南瓜,stringr
链接
建议 knitr,aroma.light,affxparser,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 TIN_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 TIN_1.20.0.zip
macOS 10.13(高山脉) TIN_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TIN
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/锡
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TIN/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网