TEQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.TEQC

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见TEQC．

目标捕获实验的质量控制

Bioconductor版本:3.11

目标捕获实验结合了基于杂交的(在溶液中或微阵列上)捕获和富集感兴趣的基因组区域(例如外显子组)，并对捕获的DNA片段进行高通量测序。该包提供了用于评估和可视化目标富集过程质量的功能，如捕获的特异性和敏感性，每个目标读取覆盖率等等。

作者:M. Hummel, S. Bonnin, E. Lowy, G. Roma

维修工:Manuela Hummel

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TEQC")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TEQC”)

PDF	R脚本	TEQC
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	遗传学，微阵列，质量控制，测序，软件
版本	4.10.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(9.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),IRanges(> = 1.13.5),Rsamtools，hwriter
进口	Biobase(> = 2.15.1)
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	TEQC_4.10.0.tar.gz
Windows二进制	TEQC_4.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TEQC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TEQC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TEQC/
软件包下载报告	下载数据