此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TDARACNE.
Bioconductor版本:3.11
从时间序列测量中推断基因网络是目前生物信息学研究领域的一个挑战。为了检测不同时间延迟下基因之间的依赖关系,我们提出了一种从时间序列测量中推断基因调控网络的方法,该方法从一个基于信息论的著名算法开始。本文提出的算法可用于从时间过程数据重建小型生物定向网络。
作者:Zoppoli P.,Morganella S., Ceccarelli M.。
维护者:Zoppoli Pietro < Zoppoli。Pietro在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“TDARACNE”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("TDARACNE")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“TDARACNE”)
R脚本 | TDARACNE | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,软件,TimeCourse |
版本 | 1.38.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(9.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | GenKern,Rgraphviz,Biobase |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | TDARACNE_1.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | TDARACNE_1.38.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | TDARACNE_1.38.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TDARACNE |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TDARACNE |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TDARACNE/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |