TDARACNE

DOI:10.18129 / B9.bioc.TDARACNE

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TDARACNE

从时间过程数据进行网络逆向工程。

Bioconductor版本:3.11

从时间序列测量中推断基因网络是目前生物信息学研究领域的一个挑战。为了检测不同时间延迟下基因之间的依赖关系,我们提出了一种从时间序列测量中推断基因调控网络的方法,该方法从一个基于信息论的著名算法开始。本文提出的算法可用于从时间过程数据重建小型生物定向网络。

作者:Zoppoli P.,Morganella S., Ceccarelli M.。

维护者:Zoppoli Pietro < Zoppoli。Pietro在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“TDARACNE”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("TDARACNE")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TDARACNE”)

PDF R脚本 TDARACNE
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列软件TimeCourse
版本 1.38.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(9.5年)
许可证 GPL-2
取决于 GenKernRgraphvizBiobase
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建议
SystemRequirements
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包档案

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源包 TDARACNE_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 TDARACNE_1.38.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) TDARACNE_1.38.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TDARACNE
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TDARACNE
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TDARACNE/
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