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SynMut
DOI:10.18129 / B9.bioc.SynMut
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SynMut。
SynMut:设计同义突变序列具有不同基因签名
Bioconductor版本:3.11
越来越多的要求设计病毒突变体与特定的二核苷酸或密码子组成。这个工具可以把二核苷酸偏好和/或密码子使用偏见突变体设计时考虑。它是一个功能强大的工具,在计算机设计的DNA序列突变体。
作者:Haogao Gu (aut (cre),狮子座L.M. Poon(领导)
维修工:Haogao顾< hggu在connect.hku.hk >
从内部引用(R,回车引用(“SynMut”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SynMut”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SynMut”)
| HTML | R脚本 | SynMut:设计同义突变的DNA序列 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ExperimentalDesign,预处理,SequenceMatching,软件 |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | |
| 进口 | seqinr、方法、Biostrings,stringr,BiocGenerics |
| 链接 | |
| 建议 | BiocManager,knitr,rmarkdown,testthat,devtools,prettydoc,胶水 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/Koohoko/SynMut |
| BugReports | https://github.com/Koohoko/SynMut/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | SynMut_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SynMut_1.4.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | SynMut_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SynMut |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SynMut |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SynMut/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
