SynMut

DOI:10.18129 / B9.bioc.SynMut

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SynMut

SynMut:设计同义突变序列具有不同基因签名

Bioconductor版本:3.11

越来越多的要求设计病毒突变体与特定的二核苷酸或密码子组成。这个工具可以把二核苷酸偏好和/或密码子使用偏见突变体设计时考虑。它是一个功能强大的工具,在计算机设计的DNA序列突变体。

作者:Haogao Gu (aut (cre),狮子座L.M. Poon(领导)

维修工:Haogao顾< hggu在connect.hku.hk >

从内部引用(R,回车引用(“SynMut”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SynMut”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SynMut”)

HTML R脚本 SynMut:设计同义突变的DNA序列
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ExperimentalDesign,预处理,SequenceMatching,软件
版本 1.4.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (r - 3.6)(1.5年)
许可证 GPL-2
取决于
进口 seqinr、方法、Biostrings,stringr,BiocGenerics
链接
建议 BiocManager,knitr,rmarkdown,testthat,devtools,prettydoc,胶水
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/Koohoko/SynMut
BugReports https://github.com/Koohoko/SynMut/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 SynMut_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 SynMut_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉) SynMut_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SynMut
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SynMut
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SynMut/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网