STRINGdb

DOI:10.18129 / B9.bioc.STRINGdb

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见STRINGdb．

检索相互作用蛋白质数据库的搜索工具

Bioconductor版本:3.11

STRINGdb包提供了一个到STRING蛋白质相互作用数据库(https://www.string-db.org)的R接口。

作者:Andrea Franceschini < Andrea . Franceschini at isb- sibling .ch>

维护者:Damian Szklarczyk < Damian。Szklarczyk在imls.uzh.ch>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“STRINGdb”)

PDF	R脚本	STRINGdb装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	网络，软件
版本	2.0.2
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(7年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.14.0)
进口	png，sqldf，plyr，igraph，RCurl、方法、RColorBrewer，gplots，哈希，plotrix
链接
建议	RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	PPInfer，scsR
进口我	coexnet，glmSparseNet，IMMAN，pwOmics，日坛，XINA
建议我	epiNEM，GeneNetworkBuilder，netSmooth，PCAN
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	STRINGdb_2.0.2.tar.gz
Windows二进制	STRINGdb_2.0.2.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	STRINGdb_2.0.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/STRINGdb
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/STRINGdb
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/STRINGdb/
软件包下载报告	下载数据